O objetivo deste estudo foi desenvolver um sistema web para gestão do Programa Saúde na Escola (PSE) na cidade de Manaus-Amazonas e utilizar métodos estatísticos para a mensuração da qualidade de software. O PSE é um programa que visa articular saúde, educação e outras frentes sociais para o enfretamento das vulnerabilidades que comprometam o desenvolvimento de estudantes. Contudo, os acessos às informações produzidas por este programa, apresentavam obstáculos por conta da falta de disponibilidade, organização e centralização da informação. Aplicou-se o método ágil SCRUM da Engenharia de Software para o desenvolvimento de um sistema informatizado visando solucionar um problema real. Utilizou-se a linguagem de programação PHP, banco de dados MySQL e arquitetura web cliente-servidor. O processo de avaliação do software foi realizado por vinte profissionais, sendo dez da área de saúde e dez da área de exatas e tecnologia da informação. Todos os profissionais atenderam aos critérios estabelecidos, possuindo formação e vasta experiência no conteúdo testado. Todos responderam às perguntas sobre funcionalidade, confiabilidade, usabilidade, performance, compatibilidade, segurança, adaptabilidade e manutenibilidade. O modelo de qualidade adotado neste estudo foi o da norma ISO/IEC 25010 e o processo de avaliação foi o da ABNT NBR ISO/IEC 14598. Evidenciou-se, neste estudo, que a utilização do sistema web informatizado viabilizou a integração entre os profissionais da secretaria municipal de saúde (SEMSA) e secretaria municipal de educação (SEMED), assegurando a qualidade e acelerando o processo de atendimento e tratamento ao estudando através do PSE.